Mitsuha Miyamizu, seorang siswi SMA, ingin menjalani kehidupan layaknya seorang anak laki-laki di kota Tokyo yang ramai—mimpi yang sangat kontras dengan kehidupannya saat ini di pedesaan. Sementara itu, di kota, Taki Tachibana menjalani kehidupan yang sibuk sebagai siswa SMA sambil menjalani pekerjaan paruh waktunya dan berharap masa depan di bidang arsitektur.
Suatu hari, Mitsuha terbangun di sebuah kamar yang bukan miliknya dan tiba-tiba mendapati dirinya menjalani kehidupan impian di Tokyo—tetapi dalam tubuh Taki! Di tempat lain, Taki mendapati dirinya menjalani kehidupan Mitsuha di pedesaan yang sederhana. Dalam upaya mencari jawaban atas fenomena aneh ini, mereka mulai mencari satu sama lain.
Kimi no Na wa. berkisah tentang tindakan Mitsuha dan Taki, yang mulai berdampak dramatis pada kehidupan masing-masing, menyatukannya menjadi jalinan yang disatukan oleh takdir dan keadaan.
